Aunque forman parte de un mismo conjunto, iglesia y museo tienen accesos y horarios diferenciados.
La iglesia está considerada como uno de los templos románicos más destacados de España. En el exterior se pueden admirar dos portales, ambos en la fachada meridional. En el interior se encuentran elementos arquitectónicos originales de los siglos XI y XII, así como de las importantes reformas de los siglos XV y XVI.
El museo conserva varias piezas litúrgicas de entre las que destaca el cáliz de Doña Urraca. Se expone también una veleta de los siglos V-VI, pero la joya del conjunto es el Panteón Real, con sus pinturas románicas que decoran el techo.